Gard Thomassen

Bilde av Gard Thomassen
English version of this page
Telefon +47 22840934
Mobiltelefon +47 93674926
Rom 2302
Brukernavn
Besøksadresse Gaustadalléen 23 A Kristen Nygaards hus 0373 Oslo
Postadresse Postboks 1059 Blindern 0316 Oslo

Arbeidsoppgaver:

  • Underdirektør for Avdeling for IT i Forskning ved USIT, UiO
  • Leder av sekretariatet for de strategiske koordineringsgruppene for IT ved UiO
  • Deltager i sekretariatet for Forskningsinfrastrukturutvalget
  • Deltaker fra UiO i Fagråd og Tjenesteråd for Forskning hos UNIT
  • Ansvarlig for USITs leveranser for TSD, Uninett Sigma2 AS, CERN NDGF-Tier-1, MusemsIT, Instrumentnett, Fairdata@UiO, Forskerplattformen med mer.

Diverse:

 

Bakgrunn:

  • FitSM Foundations, 2020
  • Etterutdanning på Inst for Informatikk, UiO, i IT-ledelse, IT-arkitektur, IT-governance og ledelse av komplese IT-systemer (ITLED; 4010,4021,4260,4280)
  • ITIL Foundations, 2013
  • High Throughput Sequencing / Next Generation Sequencing CCB, UIO/OUS
  • Microarray design og analyse, CMBN og CCB, UIO/OUS
  • PhD Bioinformatikk, CMBN OUS/ UIO
  • Gründerskolen
  • Cand Scient Informatikk, UIO
  • Befalsskolen for Kavaleriet, Oppklaringslinjen

Publikasjoner

  • Øvrelid, Egil; Bygstad, Bendik & Thomassen, Gard (2021). TSD: A Research Platform for Sensitive Data. Procedia Computer Science. ISSN 1877-0509. 181, s. 127–134. doi: 10.1016/j.procs.2021.01.112. Fulltekst i vitenarkiv
  • Aarestrup, FM; Albeyatti, A; Armitage, W; Auffray, C; Augello, L & Balling, Rudi [Vis alle 52 forfattere av denne artikkelen] (2020). Towards a European health research and innovation cloud (HRIC). Genome Medicine. ISSN 1756-994X. 12(18). doi: 10.1186/s13073-020-0713-z. Fulltekst i vitenarkiv
  • Lorenz, Susanne; Barøy, Tale; Sun, Jinchang; Nome, Torfinn; Vodak, Daniel & Bryne, Jan Christian [Vis alle 21 forfattere av denne artikkelen] (2016). Unscrambling the genomic chaos of osteosarcoma reveals extensive transcript fusion, recurrent rearrangements and frequent novel TP53 aberrations. OncoTarget. ISSN 1949-2553. 7(5), s. 5273–5288. doi: 10.18632/oncotarget.6567.
  • Løvf, Marthe; Thomassen, Gard O Sundby; Mertens, Fredrik; Cerveira, Nuno; Teixeira, Manuel & Lothe, Ragnhild A [Vis alle 7 forfattere av denne artikkelen] (2013). Assessment of Fusion Gene Status in Sarcomas Using a Custom Made Fusion Gene Microarray. PLOS ONE. ISSN 1932-6203. 8(8). doi: 10.1371/journal.pone.0070649.
  • Booth, James A.; Thomassen, Gard O Sundby; Rowe, Alexander D.; Weel-Sneve, Ragnhild; Lagesen, Karin & Kristiansen, Knut Ivan [Vis alle 9 forfattere av denne artikkelen] (2013). Tiling array study of MNNG treated Escherichia coli reveals a widespread transcriptional response. Scientific Reports. ISSN 2045-2322. 3. doi: 10.1038/srep03053. Fulltekst i vitenarkiv
  • Nome, Torfinn; Thomassen, Gard O Sundby; Bruun, Jarle; Ahlquist, Terje Cruickshank; Bakken, Anne Cathrine & Hoff, Andreas Midbøe [Vis alle 17 forfattere av denne artikkelen] (2013). Common fusion transcripts identified in colorectal cancer cell lines by high throughput RNA sequencing. Translational Oncology. ISSN 1944-7124. 6(5), s. 546–553. doi: 10.1593/tlo.13457. Fulltekst i vitenarkiv
  • Celestino, Ricardo; Sigstad, Eva; Løvf, Marthe; Thomassen, Gard O Sundby; Kotanska-Grøholt, Krystyna & Jørgensen, Lars Hilmar [Vis alle 13 forfattere av denne artikkelen] (2012). Survey of 548 oncogenic fusion transcripts in thyroid tumors supports the importance of the already established thyroid fusions genes. Genes, Chromosomes and Cancer. ISSN 1045-2257. 51(12), s. 1154–1164. doi: 10.1002/gcc.22003.
  • Løvf, Marthe; Thomassen, Gard O Sundby; Bakken, Anne Cathrine; Celestino, Ricardo; Fioretos, Thoas & Lind, Guro Elisabeth [Vis alle 8 forfattere av denne artikkelen] (2011). Fusion Gene Microarray Reveals Cancer Type-Specificity Among Fusion Genes. Genes, Chromosomes and Cancer. ISSN 1045-2257. 50(5), s. 348–357. doi: 10.1002/gcc.20860.
  • Thomassen, Gard O Sundby; Sneve, Ragnhild; Rowe, Alexander D.; Booth, James; Lindvall, Jessica M. & Lagesen, Karin [Vis alle 9 forfattere av denne artikkelen] (2010). Tiling Array Analysis of UV Treated Escherichia coli Predicts Novel Differentially Expressed Small Peptides. PLOS ONE. ISSN 1932-6203. 5(12). doi: 10.1371/journal.pone.0015356. Fulltekst i vitenarkiv
  • Skotheim, Rolf Inge; Thomassen, Gard O Sundby; Eken, Marthe; Lind, Guro Elisabeth; Micci, Francesca & Ribeiro, FR [Vis alle 11 forfattere av denne artikkelen] (2009). A universal assay for detection of oncogenic fusion transcripts by oligo microarray analysis. Molecular Cancer. ISSN 1476-4598. 8. doi: 10.1186/1476-4598-8-5. Fulltekst i vitenarkiv
  • Thomassen, Gard O Sundby; Rowe, Alexander D.; Lagesen, Karin; Lindvall, Jessica Margareta & Rognes, Torbjørn (2009). Custom Design and Analysis of High-Density Oligonucleotide Bacterial Tiling Microarrays. PLOS ONE. ISSN 1932-6203. 4(6). Fulltekst i vitenarkiv
  • Thomassen, Gard O. S.; Rosok, Oystein & Rognes, Torbjørn (2006). Computational prediction of microRNAs encoded in viral and other genomes. Journal of Biomedicine and Biotechnology. ISSN 1110-7243. Fulltekst i vitenarkiv

Se alle arbeider i Cristin

  • Stangeland, Elin; Soligard, Lars; Thomassen, Gard O Sundby; Bianchini, Federico & Bösl, Korbinian (2020). Data Management Planning workshop for Life Science Projects.
  • Stansberg, Christine; Willassen, Nils P; Thomassen, Gard O Sundby; Hovig, Johannes Eivind & Jonassen, Inge (2020). How open databases turn out to be crucial in the fight against Covid-19. NBS-nytt. ISSN 0801-3535. 4, s. 38–43.
  • Øvrelid, Egil; Bygstad, Bendik & Thomassen, Gard O Sundby (2020). Tsd: A Research Platform For Sensitive Data.
  • Øvrelid, Egil; Bygstad, Bendik & Thomassen, Gard O Sundby (2020). TSD: A GENERATIVE RESEARCH PLATFORM IN THE AGE OF THE PANDEMICS .
  • Eide, Hans A; Fotland, Margaret Louise; Kvale, Live Håndlykken; Stangeland, Elin; Stølen, Svein & Thomassen, Gard O Sundby [Vis alle 7 forfattere av denne artikkelen] (2015). Sharing and Storing Research Data A 4-level model of the Data flow.
  • Nakken, Sigve; Vodák, Daniel; Fournous, Ghislain; Thomassen, Gard O Sundby & Hovig, Johannes Eivind (2013). Big challenges in personalized cancer medicine. META. ISSN 1890-1956. s. 8–12.
  • Eike, Morten Christoph; Lærum, Hallvard; Hughes, Timothy; Håndstad, Tony; Bremer, Sara & Bergan, Stein [Vis alle 10 forfattere av denne artikkelen] (2012). GenAP: a platform for clinical genetic analysis of high-throughput sequencing data.
  • Eike, Morten Christoph; Lærum, Hallvard; Hughes, Timothy; Bremer, Sara; Bergan, Stein & Thomassen, Gard O Sundby [Vis alle 9 forfattere av denne artikkelen] (2012). A national platform for clinical genetic analysis of high-throughput sequencing data in Norway.
  • Skotheim, Rolf Inge; Nome, Torfinn; Thomassen, Gard O Sundby; Johannessen, Bjarne; Bakken, Anne Cathrine & Bruun, Jarle [Vis alle 10 forfattere av denne artikkelen] (2012). Identification of Fusion Transcripts in Colorectal Cancer by Combined RNA-seq and Exon Microarray Analyses. European Journal of Cancer. ISSN 0959-8049. 48, s. S121–S121.
  • Løvf, Marthe; Thomassen, Gard O Sundby; Lind, Guro Elisabeth; Lothe, Ragnhild A & Skotheim, Rolf Inge (2010). An oligo microarray design for detection of known and putative oncogenic fusion transcripts. European Journal of Cancer. ISSN 0959-8049. 8(5), s. 199–199.
  • Skotheim, Rolf Inge; Eken, Marthe; Thomassen, Gard O Sundby; Lind, Guro Elisabeth & Lothe, Ragnhild A (2009). A universal assay for detection of oncogenic fusion transcripts by oligo microarray analysis. European Journal of Cancer. ISSN 0959-8049. 7(2), s. 147–148.
  • Thomassen, Gard O Sundby & Rognes, Torbjørn (2010). Design, analysis and applications of custom high-density oligonucleotide microarrays. Unipub forlag. ISSN 978-82-8072-495-3.

Se alle arbeider i Cristin

Publisert 20. des. 2012 11:20 - Sist endret 23. nov. 2021 13:03