Prosjektplan for TSD utvikling

eCoLab og eVIR

Mandat

Mandatet er å gi CoLabs og eVIR den støtte som de ble lovet fra USIT i forbindelse med de respektive miljøers søknad om å bygge TSD-integrert infrastruktur for videohøsting og videoanalyse. Dette inkluderer også video mgmt system og om mulig også metadatabase.

Prosjektforslag

Prosjektet omfatter høsting av video frikoplet fra TSD. Her er USIT ikke involvert. Og høsting av video som går direkte til TSD, her er USIT involvert hos Ecolabs og hos PSI delen av eVIR. Videre skal TSD fasilitetere lagring av video. Video management og video analyse. I forbindelse med analysefasen er VDI løsning fra VMware med windows 7 klienter eneste farbare vei jfr prosjektets utrednings og testfase.

Dokumentasjon finnes her https://www.usit.uio.no/om/organisasjon/uav/itf/ft/dokumentasjon/evir-oslo-videolabs/

Prosjektet organiseres med Gard Thomassen som prosjektleder. Magnus Hovland (GFS) koordinerer AV-arbeidet.

Varighet 15/8-14 til 15/8-15. Da skal systemene gå i produksjon og driftsavtale må være på plass.

Ressurser

Vegard Korvald er avgitt fra FT til GFS for å dekke ressursbehovet for prosjektet, hans stilling finansieres 50% av eCoLabs. Videre er Martin Benoninsen avgitt fra FT til GD for å jobbe i prosjektet, hans stilling finansieres 50% av eVIR. Utgifter dekkes av prosjektmiljøene eller av TSD sin investeringspott.

Ute hos fagmiljøene er lokal IT til dels frikjøpt for å jobbe tett mot prosjektene.

Ressursavtale ligger i at prosjektet har avgitt to personer til Drift.

Leveranser

Detaljer for prosjektet finnes i avtalene for eCoLabs og eVIR.

Oppsummert :

• Opptaksmulighet til TSD fra PSI (~15 rom 1 kamera + 1 mic pr rom)
• Opptaksmulighet fra studio / videokonferanse ved eCoLabs
• Import og eksportmulighet til TSD av video
• Analyse av video i TSD (Adobe Premiere Pro og InterAct)
• Video MGMT system, med tilgangskontroll
• Video metadatabasesystem

Milepæler og aktiviteter

Siden dette er et utviklings / forskningsprosjekt vil vi kun ha et fåtall milepæler disse er listet her :

Rapporteringsrutiner

Rapportering gjøres tertialsvis for prosjektet, med første rapport 1 tertial 2015.

Avvikshåndtering

Avvik varsles oppdragsgiver og prosjekteier så snart som mulig, senest i tertialrapportene.

Endringshåndtering

Dette er forsknings/utviklingsprosjekt og endringer avtales fortløpende med oppdragsgiver

Kommunikasjon og opplæring

Opplæring og kommunikasjon foregår i tett samarbeid med oppdragsgivere og vider driftsavtale må også omtale dette.

Overlevering

Overlevering skjer senest 15/8-15 av de deler som ikke er internt i TSD. Videre driftsavtale skal være på plass innen 1/6-15.

Oppfølging av interessenter/målgrupper

Oppdragsgivere er hovedinteressenter og disse følges opp nøye i ukentlige møter med større eller mindre deler av prosjektorganisasjonen.

Risikostyring

Risiki i prosjektet drøftes fortløpende med oppdragsgivere og rapporteres senest til oppdragsivere og prosjekteier i tertialrapporten.

Risikoanalyse av selve systemet inngår i TSD risikoevaluering.

Tryggve (Galaxy i TSD mm)

Mandat

TSD deltar på oppdrag av Elixir.uio.no / NeIC i det Nordiske Tryggve prosjektet og skal levere dit ihht hva Elixir bestemmer er norsk leveranse til Tryggve. Arbeidet koordineres av Tryggve prosjektleder Antti Pursula ved CSC, FI. Mange vanlige prosjektpunkt ved USIT er derfor overflødige i dette tilfellet.

Ressurser

• Maria F. Iozzi, finansieres 50% av NeIC for Tryggve i perioden 1/1-15 til 1/3-17. Stillingen dekkes av Gard Thomassen i Iozzis mammaperm. (ITF/FT) (Fungerer som USIT PL for Tryggve)
• Abdulrahman Azab, finansieres 50% av NeIC for Tryggve i perioden 1/1-15 til 1/3-17. (ITF/FT)
• Gard Thomassen, deltar i referansegruppen til prosjektet (ITF/FT).

Rapporteringsrutiner

Det rapporteres tertialvis.

Invariantlagring og kopling til Cristin

Mandat

Dette er et porteføljemiddel-utviklingsprosjekt for å kunne tilby invariantlagring av forskningsdata (også mtp sensitive data) i TSD, og der vi kan kople invariantdatasett mot en unik identifikator i Cristin.

Prosjektforslag

Prosjektet består av to deler

• Mulighet til invariantlagring av datasett i TSD
• Kopling mellom Cristin og invariantdatasett

Ressurser

Porteføljemidlene for 2015 er på rundt 700kKR.

Leveranser

• TSD skal innen utløpet av 2015 tilby en enkel måte for invariantlagring av datasett i TSD der checksum for datasettet gjøres offentlig tilgjengelig
• TSD skal så innen utløpet av 2015 (evt fort som mulig etter dette, avhengig av Cristin) tilby at en unik identifikator kan legges i Cristin og peke til et invariantdatasett i TSD, inkludert checksum.

Milepæler og aktiviteter

Se : http://www.usit.uio.no/om/organisasjon/uav/itf/ft/planer/2015/#toc8

Rapporteringsrutiner

Det rapporteres teritalvis.

Avvikshåndtering

Avvik meldes til prosjekteier snarest, senest ved tertialrapportene.

Endringshåndtering

Endringer drøftes med oppdragsgiver og samarbeidspartnere fortløpende.

Kommunikasjon og opplæring

Når leveransene er klare må mulighetene kommuniseres tydelig til sluttbrukergruppene. Dette er ikke planlagt ytterligere pt.

Overlevering

Produktet overleveres til TSD tjenestegruppe for videre drift og forblir et samarbeid mellom TSD Tjenestegruppe og Cristin mtp den unike identifikatoren.

Oppfølging av interessenter/målgrupper

Interessen hos brukergrupper er kartlagt tidligere og det er også et tydelig signal fra tidsskriftene (særlig innen biomedisin) om at man skal kunne garantere uendrede datasett for etterprøvbarhet. Den store verdiskaperen her er om vi kan tilby dette enkelt samt kople data mellom Cristin og TSD slik at forskergrupper kun trenger å registrere informasjon 1 gang.

Risikostyring

Risiki i prosjektet drøftes fortløpende med oppdragsgivere og rapporteres senest til oppdragsivere og prosjekteier i tertialrapporten.

Risikoanalyse av selve systemet inngår i TSD risikoevaluering.

Journalsystem i TSD (for PSI)

Mandat

TSD skal jfr Universitetsledelsen til tjenester for lagring av sensitive data ved UIO. Ved PSI har man en klinikk som lovmessig er påplagt et sikkert journalsystem og eneste farbare vei synes å være å etablere systemet i TSD. Journalsystemet kommer fra Univ i Umeå og er gitt til PIS, UIO gratis. Systemet skal implementeres og tilpasses PSI i løpet av 1/8-14-1/8-15, og deretter gå i drift. Driftsavtale skal skrives før driftsfasen starter.

Prosjektforslag

Bakgrunn, se mandat.

I prosjektet skal TSD sørge for at Journalsystemet blir installert i TSD og fornorsket og klargjort til driftsfase.

Ressurser

PSI har avgitt midler til 1FTE ved GAD, FTE styres av TSD men ligger i GAD. FTE deles mellom Anne-Grethe Knudsen og Robert Frøseth. Videre har PSI frikjøpt Egil Bergh Telle (SV-IT) for bistand med prosessen og for å få opplæring mtp driftsfasen.

Leveranser

• Testmiljø satt opp utenfor TSD
• PSI får teste og komme med endringsforslag og oversettelsesforslag
• Prodmiljø settes opp i TSD
• Driftsavtale etableres
• Overlevering til Drift

Milepæler og aktiviteter

Se årsplan FT for TSD http://www.usit.uio.no/om/organisasjon/uav/itf/ft/planer/2015/#toc5

Rapporteringsrutiner

Rapportering foregår tertialvis

Avvikshåndtering

Avvik rapporteres prosjekteier omgående, senest i tertialrapport.

Endringshåndtering

Endringer avklares mellom PSI og TSD

Kommunikasjon og opplæring

Opplæring er i gang via SV-IT, men dette er et viktig punkt for driftsavtalen.

Overlevering

TSD tjenestegruppe får tildelt produktet for drift ved driftssettelse. PSI må bistå med midler for å dekke drift, dette defineres i driftsavtalen.

Oppfølging av interessenter/målgrupper

Prosjektmøter med oppdragsgiver avholdes minimum månedlig.

Risikostyring

Risiki i prosjektet drøftes fortløpende med oppdragsgivere og rapporteres senest til oppdragsivere og prosjekteier i tertialrapporten.

Risikoanalyse av selve systemet inngår i TSD risikoevaluering.

Klinisk bruk av TSD (samarbeid med OUS/AMG)

Mandat

TSD skal fasiliterer lagring og analyse av gendata (RNA/DNA dypsekvenseringsdata) i TSD for Avdeling for Medisinsk Genetikk (AMG) ved OUS. Det antas at flere miljø vd OUS vil kopiere dette pilotmiljøet i den kommende 4 årsperiode der man antar at OUS / Sykehusparter ikke klarer å fasilitere dette. TSD ksal også samarbeide med OUS om gode og enkle måter for å flytte data mellom OUS og TSD t/R.

Prosjektforslag

TSD skal benyttes til klinisk dypsekvensering og må tilpasses til å yte det som OUS krever av et slikt system. Prosjektet løper 1/1-15 til 1/7-15 og går i produksjon 1/8-15 og antas å vare i 3-4 år fra produksjonsstart.

Ressurser

Prosjektet har egne midler til investeringer i HW og andre oppstartskostnader. Drift skal dekkes av egen driftsavtale som skal løpe fra 1/8-15.

Gard Thomassen og Espen Grøndahl er avgitt av IT-dir til prosjektet i den utstrekning de trengs. TSD må stille med ressurser som kreves for dette. Ingen spesielle avtaler er gjort for dette. Gard Thomassen er prosjektleder ved TSD/USIT.

IT-dir sitter i prosjektets styringsgruppe.

Leveranser

• TSD skal ha ihvertfall ett prosjektområde klart for bruk for klinisk dypsekvensering fra 1/8-15. Her skal også data import og eksport være forenklet så mye som mulig.
• Driftsavtale for videre drift skal være på plass innen 1/5-15

Milepæler og aktiviteter

Prosjektet ledes av Pia Nybo Skaar ved OUS IKT og organiseres fullt og helt der. Gard Thomassen leder prosjektet/utviklingen ved TSD. 

Rapporteringsrutiner

Det rapporteres tertialvis her på TSD utvikling prosjektet