Rapport TSD-UTV T2, 2015
- Ecolabs og eVIR (avsluttet 15/8-15, flyttes til TSD tjenstegruppe):
TSD har på plass VDI infrastruktur med tilfredsstillende videokapasitet og kvalitet. I TSD er nå innhenting av video fra PSI lab, samt ACL nedlåsning av nett TSD-USIT-PSI på plass. Prosjektet er formelt avsluttet, men vi har, fremdeles, muntlig referatført avtale om å bistå prosjektet m,ed 20% FTE ut året (15/8 - 31/12-15). Det som gjenstår nå er ytterligere testing, samt utestående arbeid med metadatabase for video. Metadatabase for videodata er ikke en hovedleveranse i prosjektet og var en "nice to have" som dukket opp underveis. Martin og Vegard med flere har levert godt inn i prosjektet, sluttbrukere er både fornøyd og imponert over hva som har blitt levert så langt.
Det har blitt levert 928 timer i 2 tertial til prosjektet. eVIR prosjektet har utestående midler som er ønsket investert i HW i TSD, videre gjenstår det en regning på 170.000 NOK fra Magnus H på replay-support for 3 år, denne må dekkes av miljøene.
Ecolabs : TSD/USIT har levert ihht avtale. Resterende bistand og rådgiving følger IT-organisasjonenes retningslinjer for brukerhenvendelser. "
eVIR miljøet har fått gjennomslag for sin oppfølger hos NFR "evir2", her ligger det innbakt 50% FTE in-kind fra USIT mot 50% FTE dekket av prosjektet og en årlig jevn investering på 500KNOK i hardware for eVIR. Akkurat hvordan ressurssituasjonen løses får avklares med drift når eVIR2 formelt er godkjent og bevilgningen gitt ved NFR. Jobben for USIT i dette tilfellet er oppskalering og finpussing av dagens løsning, altså ingen vesentlige utvidelser.
- Tryggve - Galaxy i TSD (ferdig 31.03.2018):
TSD kan i dag levere Galaxy til prosjekter i TSD, men grunnet sikkerhetsutfordringer med Docker teknologien som er valgt for dette har visse sikkerhetsutfordringer som er forventet løst i neste revisjon av system vil vi ikke slippe denne tjenesten før Docker har adressert disse utfordringene. Vi ser at RHEL 7 gir oss Docker native, men RHEL 7 har utfordringer med FirewallD mtp innslipp i TSD så dette vil ta noe mer tid. Vi vet også fra Danmark og Sverige at FirewallD har skapt utfordringer. Abdulrahman har levert godt inn i prosjektet, og vil nå rulle ut Docker + Galaxy for p66 i TSD som en test for det miljøet. Francesca er nå tilbake på jobb og vil holde i Tryggve til vi evt har en erstatning på plass nå som hun skal bli gruppeleder. Vi får tilbakemeldinger fra Tryggve om at vi leverer tilfredsstillende, Gard stillte på Tryggve referansegruppemøte i Stockholm 10/9-15.
- Invariantlagring og kopling til Cristin (ferdig 31.12.15):
Vi får dessverre lite respons fra Cristin, men vi har en avtale med Norstore om å integrere med deres arkiv slik at data-sjekksum får en checksum og invariant-garanti ved opplastning der, samt at vi får en løsning for de data som ikke er ønsket lagt i Norstore. Antageligvis må koplingen til Cristin komme på noe sikt og det antas at midler for videre utvikling må overføres til neste år grunnet treghet i samarbeidende systemer. Leon du Toit i FT er hovedressurs på systemet, vi har ikke eget CT kode men har oiversikt på hvor mange timer som er ført til nå (~75 timer). Ide : TSD/FT skal etablere et mottak og et system for å lagre (sensitive) forskningsdata der man fryser ned data og en checksum av data, kryptonøkkel og checksum lagres i et eget TSD prosjekt med begrenset tilgang. Dette medfører at vi kan garantere at f.eks rådata er urørt i studie X for forsker Y om forsker Y deponerte data til FT/TSD. Videre skal vi få inn en unik identifikator i Cristin for de datasett som har et invariantsett lagret ved FT/TSD.
- Journalsystem for PSI i TSD (avsluttet 15/8-15, flyttes til TSD Tjenstegruppe):
Journalsystemet fungerer som foreskrevet i TSD, Robert F i GAD har gjort en del tilpassninger og flere er ønsket, vi skal rapportere tilbake om hva som er mulig og ikke mulig innenfor rammen 50% av FTE. Vi skal nå få på plass std driftsavtale for dette og har bedt admin USIT om hjelp med dette. Mulig PSI henter inn Bjørn A fra Sverige for å gå videre med utviklingen i forsert tempo, dette på Gards oppfordring. PSI er MEGET fornøyd med systemet og mener det gir dem en helt ny og bedre hverdag, både administrativt men også forskningsmessig og metodemessig.
Første produksjon med studenter fra PSI er planlagt 1/12-15. Robert i GAD har levert godt inn i prosjektet og det har blitt ført 326,25 timer på eJournal. Dette er litt for lite i forhold til kontrakten, og GAD er varslet. Vi antar ingen kommentarer fra PSI om dette så lenge eJournalen fungerer.
- Klinisk bruk av TSD for AMG, OUS (avsluttet 1/8-15, flyttes til TSD Tjenstegruppe)
Alt er levert fra TSD inkludert nytt blad operativt i TSD, kvoter er økt og intern filsluse er i orden. Det som gjenstår før faktisk bruk er nå en ferdigstillelse av ROS analyse internt ved OUS, TSD er ferdige i hovedleveransen og er i ferd med å avslutte delleveranse om copy-paste mellom TSD og OUS-klinisk maskin. Kontrakten er signert, intensjon er 3 år minimum, og Martin B sin finansiering er således på plass ihht plan, CT kode "TSD AMG" er bestillt.
Av
Gard Thomassen
Publisert 14. sep. 2015 09:22
- Sist endret 16. sep. 2015 10:14